Rektorem Wyższego Misyjnego Seminarium Duchownego w Bydgoszczy został o. Marek Karczewski, który zastąpił na tym stanowisku o. Zbigniewa Szadurę, pełniącego najwyższe uczelniane funkcje przez ostatnie 7 lat. Na prefekta nominowano o. Bogusława Wojtko, a ojcem duchownym został o. Jan Popa.
Nowy rektor jest absolwentem Seminarium Zgromadzenia Misjonarzy Ducha Świętego. Ukończył studia specjalistyczne z zakresu biblistyki na Akademii Teologii Katolickiej w Warszawie. Pracował w byłej Jugosławii i na polskich placówkach w Chełmszczonce i Puszczykowie. W ubiegłym roku został przełożonym wspólnoty bydgoskiej. Jako główny cel swojej misji formacyjnej zakłada nie administrowanie, ale "bycie dla kleryków".
Nowy rok akademicki rozpoczęło w Seminarium 16 kleryków. Od czasu założenia uczelni, czyli 1976 r., wykształciło się w jej murach 50 ojców. Część z nich pracuje w polskich domach: w Puszczykowie, Chojnicach, Chełmszczonce, Cielądzu i Zbyszycach. Część zapełnia ośrodki misyjne poza granicami kraju - głównie w Europie Zachodniej, Afryce i obu Amerykach.
Na pewno nie byłoby Seminarium im. bł. Jakuba Lavala, gdyby nie było Duchaczy. Ich historia w Polsce sięga 1921 r. Wtedy, razem z armią generała Hallera, przybyli do Polski pierwsi członkowie Zgromadzenia Ducha Świętego. Od roku 1925 w domu przy ul. Kujawskiej 117 w Bydgoszczy, pod opieką o. dr. Stanisława Kolipińskiego funkcjonował Internat Ducha Świętego, który kształcił młodzież męską w zakresie szkoły średniej. Okres II wojny światowej i czas powojenny zahamowały działalność Zgromadzenia w Polsce. Po "odwilży" w 1956 r. nastąpił powolny, naznaczony olbrzymim wysiłkiem, czas odbudowy. Pojawiali się nowi kandydaci, którzy pragnęli służyć Bogu i ludziom na misjach w myśl spiritańskiej Reguły Życia. Ich studia (filozoficzno-teologiczne) odbywały się w Seminarium Zagranicznym Księży Chrystusowców w Poznaniu.
Od roku 1976, dzięki staraniom i zabiegom o. Józefa Kolaśnego CSSp, istnieje Seminarium Zgromadzenia Ducha Świętego im bł. Jakuba Lavala. Obok działalności formacyjnej bydgoski ośrodek podejmuje szereg różnych działań, m.in. coroczną animację Tygodnia Misyjnego, kierowanie letnią akcją dla młodzieży męskiej w Legbądzie - "Wakacje z Bogiem". Klerycy pomagają w prowadzeniu takich grup jak Duszpasterstwo Młodzieży czy Wspólnota Przyjaciół Misji. Towarzyszą nieuleczalnie chorym w ośrodkach opieki paliatywnej. Znajdują także pracę w Pogotowiu Opiekuńczym - ośrodku zajmującym się trudną młodzieżą.
Obecnie Seminarium przeżywa równomierny i stały rozwój, dostosowując i wypełniając program formacji, zarówno do potrzeb Kościoła i misji, jak i wymogów Uniwersytetu Adama Mickiewicza w Poznaniu. Od października 2000 r. bydgoskie Seminarium jest filią Wydziału Teologicznego UAM. Seminaryjna biblioteka, z której korzystają zarówno klerycy, jak i osoby świeckie, od 1997 r. należy do Krajowej Federacji Bibliotek Kościelnych - "FIDES".